Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms