Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IMPG1Q17R60 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms