Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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NEUROD1Q13562 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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NEUROD1Q13562 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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NEUROD1Q13562 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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NEUROD1Q13562 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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NEUROD1Q13562 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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