Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTP4A2Q12974 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms