Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms