Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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