Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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