Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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