Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms