Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms