Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
UBXN4Q92575 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms