Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms