Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CFAP100Q494V2 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms