Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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