Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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