Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SYCP1Q15431 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SYCP1Q15431 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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SYCP1Q15431 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SYCP1Q15431 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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SYCP1Q15431 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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