Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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