Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms