Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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CUL1Q13616 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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