Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GRIK2Q13002 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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