Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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