Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SLITRK1-201ENST00000377084 5189 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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