Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TMPOP42166 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TMPOP42166 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TMPOP42166 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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