Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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