Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CASQ1P31415 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CASQ1P31415 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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