Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MAP3K14-201ENST00000344686 4460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RPH3A-213ENST00000548866 2429 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NOP2-218ENST00000545200 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC211476.4-201ENST00000275546 699 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL136226.1-201ENST00000401715 802 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL512353.1-201ENST00000414798 514 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL772155.1-201ENST00000431077 347 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL606490.6-201ENST00000453735 523 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LINC00499-204ENST00000515282 579 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC011726.2-201ENST00000522547 508 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC015853.1-201ENST00000574008 592 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RN7SL804P-201ENST00000582466 298 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GLOD4-219ENST00000628529 111 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MIR486-2-201ENST00000637446 64 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CAB39L-201ENST00000347776 3361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GSDMB-212ENST00000520542 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZNF587B-203ENST00000594901 2118 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TCAF2-204ENST00000441159 5568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC005618.2-201ENST00000618012 2297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KCNMA1-264ENST00000639544 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FAM153B-201ENST00000253490 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CACNA1C-203ENST00000344100 6634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZNF610-201ENST00000321287 2150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC060780.1-203ENST00000634503 2406 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KLHL1-201ENST00000377844 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ACSBG2-210ENST00000591403 2690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 VNN3-208ENST00000427187 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RPL7L1P2-201ENST00000446889 739 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RN7SL151P-201ENST00000460537 283 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RN7SL465P-201ENST00000468411 301 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RN7SL159P-201ENST00000485164 292 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC008696.1-201ENST00000502593 615 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC008663.3-201ENST00000520300 457 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC090568.2-201ENST00000523254 497 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLC25A3P2-201ENST00000547720 880 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC004448.4-211ENST00000582654 485 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC005618.1-202ENST00000606674 544 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TARS-216ENST00000627006 171 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC010507.2-201ENST00000632795 676 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MAPKBP1-201ENST00000456763 7158 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 VAC14-AS1-202ENST00000562507 4853 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CLIP1-219ENST00000620786 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FCRLA-209ENST00000367957 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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