Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 ZNF366-201ENST00000318442 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 SH3GL3-201ENST00000324537 2012 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 HHAT-207ENST00000541565 3164 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRHP20396 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 SEC16B-204ENST00000464631 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 EYA1-204ENST00000388741 3404 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 CES5A-203ENST00000518005 2092 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 STX12-201ENST00000373943 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 LIPC-201ENST00000299022 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 BPNT1-205ENST00000469520 2737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 AC034229.3-201ENST00000606203 2436 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 S100A7A-203ENST00000368729 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRHP20396 DGKI-213ENST00000614521 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRHP20396 CFAP69-201ENST00000389297 3902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRHP20396 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRHP20396 BTBD16-201ENST00000260723 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRHP20396 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRHP20396 AL022323.3-201ENST00000623888 5388 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TRHP20396 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms