Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLDN9O95484 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms