Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.9 ms