Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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SH3BP1Q9Y3L3 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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SH3BP1Q9Y3L3 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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SH3BP1Q9Y3L3 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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SH3BP1Q9Y3L3 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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SH3BP1Q9Y3L3 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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SH3BP1Q9Y3L3 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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SH3BP1Q9Y3L3 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
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SH3BP1Q9Y3L3 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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