Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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