Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 GS1-279B7.1-201ENST00000562817 399 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC01827-201ENST00000432711 555 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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