Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEDD1Q8NHV4 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms