Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL078645.2-201ENST00000245811 1325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SPACA7-202ENST00000375699 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL732414.1-201ENST00000413346 573 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL161447.1-201ENST00000427811 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 IGFL2-202ENST00000434646 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DEFT1P2-201ENST00000453669 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BUB3P1-201ENST00000458451 999 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL658P-201ENST00000463595 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC090311.1-201ENST00000490739 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC027343.3-201ENST00000504494 564 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ENPP7P1-201ENST00000509557 999 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RAET1E-205ENST00000529948 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NINJ2-205ENST00000542920 670 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009118.1-201ENST00000566019 374 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ALOX12-AS1-207ENST00000574377 886 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MIR3650-201ENST00000581972 60 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRBV7-9-201ENST00000612787 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ADAM6-202ENST00000616762 999 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP001469.1-202ENST00000626933 695 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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ANKRD39Q53RE8 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC83-202ENST00000342404 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF449-202ENST00000370761 2051 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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