Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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