Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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