Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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