Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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