Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA9Q13797 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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