Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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