Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP000866.3-201ENST00000534607 433 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC015574.1-201ENST00000615194 489 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.175-201ENST00000619837 250 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 OLMALINC-206ENST00000641799 1195 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TFDP3-201ENST00000310125 1680 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MYO15A-217ENST00000615845 11860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC118282.4-201ENST00000623090 1712 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SLC17A1-201ENST00000244527 1844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 GLRA1-201ENST00000274576 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ARMC8-218ENST00000485396 1920 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC100827.3-201ENST00000566291 2155 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LY9-201ENST00000263285 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 KBTBD4-201ENST00000395288 2460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PRR27-201ENST00000344526 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 FLJ36000-201ENST00000612344 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ZNF561-201ENST00000302851 4693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SPATA46-201ENST00000367935 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 BTN2A3P-201ENST00000377662 1836 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL024509.1-201ENST00000397093 927 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 GNL3LP1-201ENST00000399458 1643 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SP2-AS1-201ENST00000411573 1738 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 CASK-208ENST00000442742 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ZNF341-AS1-203ENST00000443171 642 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL356498.1-201ENST00000443334 334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 FLJ31356-202ENST00000445878 3001 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC073465.3-201ENST00000448468 405 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 POLR2CP1-201ENST00000453699 765 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 FLT1-203ENST00000540678 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PLA2G1B-203ENST00000549767 562 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 NRXN3-215ENST00000557594 3381 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC004706.2-201ENST00000576277 294 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC067796.1-201ENST00000586795 496 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 LINC01929-201ENST00000589125 3067 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC008474.1-201ENST00000589127 573 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ZNF415-209ENST00000595813 580 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC025518.2-201ENST00000605229 492 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MIR6083-201ENST00000612737 106 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC011472.5-201ENST00000624079 508 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 GDF9-206ENST00000624492 1823 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PCYT1B-203ENST00000379145 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SIM1-201ENST00000262901 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms