Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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