Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRAF1Q13077 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms