Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC00881-201ENST00000467995 589 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms