Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms