Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TTPAP49638 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms