Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQE9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQE9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
U3KQE9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQE9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
U3KQE9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms