Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms