Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms