Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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